Ich würde dem nicht all zu viel Bedeutung beimessen:
Der Wahl-O-Mat ist nun mal ein stumpfer Vergleich ohne entsprechende Abstufung. So wie uns auf der Ebene eben nicht jede Frage relevant erscheint, so ist sie auch den Parteien gleichgültig bzw. es gibt keine klare Meinung dazu. Ich denke das vor allem die kleinen Programm-Parteien wie Linke, NPD oder auch Piraten im Gros neutral sind. So kommt dann der Abgleich zustande.
Bei den Grünen ist das anders: Die unterscheiden sich so sehr von mir, das musste einfach auffallen. Zusätzlich haben die alten Klugscheißer mit Sicherheit zu jedem Thema eine Meinung.
(Meine Ausschluss-Punkte bei denen waren sicherlich das AKW und der Bau von Offshore-Windkraftanlagen.)